Β-ออกซิเดชันคือชุดของกระบวนการที่เกิดขึ้นกับคาร์บอนใน Β ถึงคาร์บอนิล
เอนไซม์ตัวแรกในกระบวนการคือ "อะซิล โคเอ็นไซม์ เอ ดีไฮโดรจีเนส ซึ่งพบในเยื่อหุ้มไมโทคอนเดรียชั้นในและมี FAD เป็นโคแฟกเตอร์ซึ่งลดลงเป็น FADH2 และให้กำลังการรีดิวซ์แก่โคเอ็นไซม์คิว (respiratory chain) เอนไซม์นี้กระตุ้นปฏิกิริยาที่เกิดจาก acyl coenzyme A นำไปสู่การก่อตัวของ enoyl coenzyme A (ทรานส์ 2,3 enoyl coenzyme A ที่แม่นยำยิ่งขึ้น) ซึ่งเป็นระบบ α-Β (อัลคีน) ที่ไม่อิ่มตัว เอนไซม์ตัวที่สองของ b- ออกซิเดชัน คือ "อีโนอิล โคเอ็นไซม์ เอ ไฮดราเทส ซึ่งแปลงอีโนอิลเป็น L-Β ไฮดรอกซี เอซิลโคเอ็นไซม์ A เอ็นไซม์นี้มีความจำเพาะแบบสเตอริโอสำหรับไอโซเมอร์ของ L-Β ไฮดรอกซีเอซิลโคเอนไซม์ A
ปฏิกิริยาที่ตามมาจะถูกเร่งโดย แอล-Β ไฮดรอกซี เอซิล โคเอ็นไซม์ เอ ดีไฮโดรจีเนส (เอนไซม์ที่ขึ้นกับ NAD) ซึ่งเปลี่ยน L-Β ไฮดรอกซีเอซิลโคเอ็นไซม์ A เป็น b-keto acyl coenzyme A; ในเวลาเดียวกัน การลดลงของ NAD + เป็น NADH ก็เกิดขึ้น
ในที่สุดก็มีคนเข้ามาแทรกแซง ไธโอเลส (b-keto acyl coenzyme A thiolase); ปฏิกิริยายังต้องการสารไลติกแทนด้วยโคเอ็นไซม์ A: ชิ้นส่วนที่มีอะตอมของคาร์บอนสองอะตอมก่อตัวขึ้น (กล่าวคือ "อะซีติลโคเอ็นไซม์ A) และโครงกระดูกคาร์บอนที่เหลือเป็นตัวแทนของเอซิลโคเอ็นไซม์ A (เมื่อเทียบกับอะตอมเริ่มต้น มันสูญเสียอะตอมของคาร์บอนไปสองอะตอม ).
อะซิลโคเอ็นไซม์ A ที่ได้รับจาก Β-ออกซิเดชัน ทำซ้ำขั้นตอนจนกว่าจะได้เฉพาะอะซิติลโคเอ็นไซม์ A เท่านั้น
กฎเกณฑ์สัมบูรณ์: เมื่อดีไฮโดรจิเนชันเกิดขึ้นระหว่างอะตอมสองอะตอมที่อยู่ติดกันโดยมีความแตกต่างที่ชัดเจนในความสัมพันธ์ของอิเล็กตรอน โคแฟกเตอร์ของเอนไซม์ดีไฮโดรจีเนสจะเป็น NAD เกือบตลอดเวลา ในขณะที่ถ้าดีไฮโดรจิเนชันเกิดขึ้นระหว่างอะตอมสองอะตอมที่อยู่ติดกันรวมทั้ง c " ความสัมพันธ์ของอิเล็กตรอนจะมีความแตกต่างกันเล็กน้อย ปัจจัยร่วมคือ FAD
